Fludioksonil może być stosowany w celu zapobiegania i zwalczania choroby czarnych plam, choroby srebrnej zgnilizny, choroby czarnych plam, choroby gangreny oraz choroby suchego zgnilizny Fusarium na ziemniakach nasion ziemniaka,jednocześnie wywierając hamujący wpływ na chorobę ślimakową.