Fludioxonil dapat digunakan untuk mencegah dan mengendalikan penyakit bercak hitam, penyakit busuk perak, penyakit bercak hitam, penyakit gangren, dan penyakit busuk kering Fusarium pada benih kentang, selain itu juga memiliki efek penghambatan pada penyakit keropeng yang umum.